Koncepcia AOS v oblasti vedy a techniky je podmienená charakterom rezortnej štátnej vysokej školy a je definovaná v dokumente Dlhodobý zámer AOS do roku 2015. AOS sa zameriava najmä na výskum a vývoj zameraný na podporu bezpečnosti a obrany SR a rozvoj spôsobilostí OS SR v rámci bezpečnostnej komunity štátu. Prioritne preto rieši projekty výskumu a vývoja, ktorých zadávateľom je MO SR, a ktoré ich financuje zo štátneho rozpočtu prostredníctvom svojej kapitoly. Cieľom školy je, aby kvalita výskumu a vývoja a jej prepojenie s výučbou bolo samozrejmým štandardom. Študenti sú pod vedením skúsených učiteľov katedier zapájaní do riešenia výskumných projektov
Organizačné, personálne a materiálne zabezpečenie výskumu a vývoja je koordinované prorektorom pre vedu, ktorému je podriadené oddelenie pre vedu.
Oddelenie vedy plní najmä tieto úlohy:
koordinuje výskumnú a vývojovú činnosť v súlade so zákonom o organizácii štátnej podpory výskumu a vývoja v znení neskorších predpisov,
komplexne spracováva podklady pre potreby výskumu a vývoja,
podieľa sa na tvorbe hlavných plánovacích a rozborových dokumentov za oblasť výskumnej a vývojovej činnosti,
vedie prehľad o hospodárení s pridelenými rozpočtovými položkami na zabezpečenie výskumu a vývoja,
poskytuje podporu administrácie a sledovania čerpania finančných prostriedkov na projekty výskumu a vývoja,
koordinuje edičnú činnosť, spracováva plán edičnej činnosti a zabezpečuje proces prideľovania ISBN,
zabezpečuje agendu redakčnej rady a vydávanie vedeckých a vedecko-odborných periodík,
pripravuje podkladové materiály pre rokovanie vedeckej rady, organizačne zabezpečuje zasadnutia vedeckej rady vrátane činnosti tajomníka vedeckej rady,
pripravuje materiály a organizačne zabezpečuje habilitačné a inauguračné konania podľa priznaných práv,
komplexne riadi oblasť priemyselného vlastníctva v rámci Akadémie ozbrojených síl,
koordinuje študentskú vedeckú a odbornú činnosť,
zabezpečuje agendu účastníckych poplatkov (školenia, kurzy, semináre, konferencie).
