Edukačný proces v Akadémii ozbrojených síl generála Milana Rastislava Štefánika zaručuje nasledovné akademické slobody a akademické práva:
sloboda vedeckého bádania, výskumu a ďalšej tvorivej činnosti a zverejňovanie ich výsledkov v súlade so všeobecne záväznými právnymi predpismi o ochrane utajovaných skutočností,
sloboda výučby spočívajúca najmä v otvorenosti rôznym vedeckým názorom, vedeckým a výskumným metódam,
právo učiť sa pri zachovaní slobodného výberu štúdia v rámci študijných programov,
právo na slobodné vyjadrovanie vlastných názorov počas výučby v kontexte s obsahom výučby.
Využívanie akademických slobôd a akademických práv musí byť v súlade so zásadami demokracie, humanity a s právnym poriadkom Slovenskej republiky.
Pri uplatňovaní ústavných práv, akademických slobôd a akademických práv platia pre študentov a zamestnancov, ktorí sú v služobnom pomere, obmedzenia v súlade so zákonom č. 281/2015 Z. z. o štátnej službe profesionálnych vojakov ozbrojených síl Slovenskej republiky a o zmenách a doplnení niektorých zákonov, v znení neskorších predpisov.
Na akademickej pôde akadémie ozbrojených síl nesmú politické strany a politické hnutia vykonávať politickú činnosť a zakladať svoje organizácie.
Akademickú pôdu tvorí priestor vymedzený nehnuteľným majetkom, ktorý Akadémia ozbrojených síl vlastní, spravuje, má v nájme alebo kde sa plní jej poslanie a hlavné úlohy.